2006年,全市水稻、棉花、蔬菜等作物的病虫害发生3950.64千公顷次，比上年增加252.14千公顷次，防治4979.28千公顷次，比上年增加431.51千公顷次，挽回损失125.11万吨，比上年增加28.68万吨，成灾面积17.74千公顷。发生特点是：主要病虫害呈偏重发生，虫害重于病害。水稻稻飞虱、二化螟、纹枯病大发生，三化螟局部大发生，稻纵卷叶螟偏重发生，稻水象甲、稻象甲、稻蓟马、稻蝗等中等发生，稻瘟病在老区及易感品种上中等发生，其他病虫偏轻发生；棉花棉铃虫、棉叶螨、棉花枯黄萎病、斜纹夜蛾偏重发生，棉蚜、甜菜夜蛾中等发生，红铃虫、棉盲蝽象偏轻发生；蔬菜菜青虫、小菜蛾、斜纹夜蛾、甜菜夜蛾、虹豆荚螟大发生，番茄青枯病、瓜类枯萎病局部大发生，瓜绢螟、菜蚜偏重发生，其它病虫中等到偏轻发生。中晚稻稻飞虱、螟虫发生严重，在岳阳县等部分乡镇出现局部灾害，全市开展紧急防治工作，市政府办下发通知，农业部门召开专门会议，加强预测预报，广泛宣传发动，市、县、乡三级督促检查，全市没有出现大面积灾害。稻水象甲疫情急剧蔓延，由上年的汨罗市、岳阳楼区、临湘市的27个乡镇扩大到汨罗、湘阴、平江、岳阳、临湘、云溪、岳阳楼区、开发区8个县(市、区)51个乡镇，发生面积22.59千公顷，其中水稻面积17.72千公顷，公共面积4.87千公顷，以107国道、308省道及京广铁路沿线为主发生区，85%以上为零星轻发生。通过对公共面积、早稻田、晚稻及一季稻田分别采取3次防治行动，有效控制了疫情。全市没有出现连片5亩以上减产10%的情况，无单丘失收现象，一类发生丘块不防治的减产达50%。4月11日16时～12日，受强冷天气影响，加上当地大气很不稳定，产生强对流天气，出现大风、雷暴雨、冰雹，急剧降温。湘阴、平江、临湘、市城区出现大风，汨罗、湘阴、平江3县(市)11日晚普降暴雨，华容县、君山区、屈原管理区、汨罗市地处沿湖一带的局部地方降冰雹，过程降温23.2℃。这次风雨雹害，发生面大，造成房屋损坏、倒塌，雷击致人死亡。全市农作物受灾面积110.4千公顷，成灾面积60.05千公顷，绝收面积3.55千公顷，直接经济损失10960万元。豚草、加拿大一枝黄花等外来入侵生物发生 111.33千公顷，造成直接经济损失1000万元以上。