1999年8月，经市委、市政府组织有关部门召开协调会，明确在原市医药管理局的基础上，归并市卫生局的药政、药检职能组建药品监督管理局，负责对 全市药品的研制、生产、流通、使用进行行政监督和技术监督，原医药管理局履行的行业管理移交市经委。9月8日，市编委下发《关于市医药管理局更名及调整职 能的通知》。9月24日，市卫生局的药政、药检进行交接。9月28日，市药品监督管理局正式挂牌运作。
    新成立的市药品监督管理局为市政府直属机构，是市政府主管药品监督的行政执法机构，负责对全市药品的研究、生产、流通、使用等环节依法进行行政监 督和技术监督。利用监督管理手段，配合宏观调控部门贯彻实施国家医药产业政策；组织、指导全市药品监督管理方面的国际交流与合作。