市农业经营管理局于1993年7月升格为副处级事业单位。1991～1996年，市农业经营管理局内强职能，外拓功能，不断开创农村经营管理工作的新局面，为发展农业、富裕农民、稳定农村作了一定工作。全市农村财务管理日臻规范，并探索出了“双代管”(财务交乡代管、资金交乡合作基金会代管)、“三集中”(以乡镇为单位集中记帐、集中会审、集中管理会计档案)等新的管理措施；形成了领导重视、部门配合、全社会齐抓共管减轻农民负担工作的局面，使不合理负担得到了有效的控制；农村合作基金会步入健康发展的轨道，对支持和促进农村经济发展起到了良好的作用；按照“大稳定、小调整”的原则，普遍延长了耕地承包期30年，建立了土地流转机制，耕地承包合同纠纷得到及时地调解和仲裁；建立健全了农村审计制度，强化监督职能，维护了集体经济利益；通过加强自身体系建设，全市符合“六有”(有完整的机构设置、有得力的专业队伍、有较好的工作条件、有规范的管理制度、有显著的工作成绩、有一定的经济实力)条件的乡镇经管站达到145个，占总数的84%。1993～1996年，市经管局先后4次被评为全省农业经营管理和全国农业统计工作先进单位；岳阳县经管局被评为全国先进单位；全市先后有6人被评为全国先进个人；5个县(市)经管局(科)、20多个乡(镇)经管站和100多人次经管干部被评为省、市先进单位和先进个人。